RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIOB	Q8N635	442 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	NINJ1	Q92982	152 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDL1	Q96EA4	605 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		15.62	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GMNC	A6NCL1	334 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	NR5A2	O00482	541 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGPTL1	O95841	491 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	AK1	P00568	194 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	EPX	P11678	715 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF17	P17021	662 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	HK1	P19367	917 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCRC1	P31930	480 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGEA8	P43361	318 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KHK	P50053	298 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3R3	Q92569	461 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	NEURL3	Q96EH8	262 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		15.61	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424		B4DXG7	233 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SCO2	O43819	266 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC22	O60826	627 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK2	O95069	426 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ACP2	P11117	423 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	LSP1	P33241	339 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GNGT1	P63211	74 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPRE2	Q15555	327 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP5	Q16690	384 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO30	Q8TB52	745 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS33A	Q96AX1	596 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR7D2	Q96RA2	312 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF1	Q9NS23	344 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MED11	Q9P086	117 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MED13L	Q71F56	2210 aa		15.6	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2M5	A3KFT3	312 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM247	A6NEH6	219 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MSTN	O14793	375 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGPT2	O15123	496 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB5	O43674	189 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-16	P01601	117 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CD1E	P15812	388 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	STAR	P49675	285 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	15.59	■□□□□ 0.09	1e-10	■■■■■ 31.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	RAET1L	Q5VY80	246 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SAXO2	Q658L1	398 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA21	Q7Z572	469 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MARCH3	Q86UD3	253 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF527	Q8NB42	609 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CDS1	Q92903	461 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	INPP5K	Q9BT40	448 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM107B	Q9H098	131 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		15.59	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424	F8	P00451	2351 aa		15.58	■□□□□ 0.09
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1W2PP18	115 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NNC1	897 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MXE2	369 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BNH8	94 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	SCD	O00767	359 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GSN	P06396	782 aa		15.58	■□□□□ 0.08
HDAC10-216	ENST00000489424	GUSB	P08236	651 aa		15.58	■□□□□ 0.08

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