RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM71CQ8NEG0 241 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2M7Q8NG81 312 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAMM41Q96BW9 452 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZG16BQ96DA0 208 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PTGES2Q9H7Z7 377 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GALNT9Q9HCQ5 603 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZFP64Q9NPA5 681 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 KLHL1Q9NR64 748 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 USP22Q9UPT9 525 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSAG2Q9Y5P2 127 aa10.45□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 HCRTR2O43614 444 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 RASAL1O95294 804 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 UQCRBP14927 111 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC6A8P48029 635 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 KCNJ5P48544 419 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNASE1L1P49184 302 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEOX1P50221 254 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPR85P60893 370 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DMTNQ08495 405 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GANABQ14697 944 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD226Q15762 336 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYBRD1Q53TN4 286 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCN8Q6JVE9 175 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC22A16Q86VW1 577 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DHFR2Q86XF0 187 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 VRK2Q86Y07 508 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLPTM1LQ96KA5 538 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 HES7Q9BYE0 225 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 LAT2Q9GZY6 243 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PROK2Q9HC23 129 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEPPQ9NTK1 212 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 OLAHQ9NV23 265 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.44□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 NINQ8N4C6 2090 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0G2JMM0 328 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PPB8 328 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1W2PRS3 328 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRRC3CA6NJW4 275 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 KIR3DP1A8MWS1 328 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 G3V3Y1 287 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADAM10O14672 748 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBR3O75828 277 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CIB2O75838 187 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SERPINA1P01009 418 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRYABP02511 175 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 OPN1SWP03999 348 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 NCK1P16333 377 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 P2RX1P51575 399 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRYBA2P53672 197 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SELENOWP63302 87 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF117Q03924 483 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOXO1Q12778 655 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SKP2Q13309 424 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBFBQ13951 182 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 FLOT2Q14254 428 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBLL1Q75N03 491 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF550Q7Z398 422 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 FADS6Q8N9I5 356 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 GATSQ8NAP1 163 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMYD1Q8NB12 490 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DUSP19Q8WTR2 217 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PROX1Q92786 737 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARSGQ96EG1 525 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRGUKQ96M69 825 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 TTTY12Q9BZ98 90 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCDHAC1Q9H158 963 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.43□□□□□ -0.74
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A087WZY1 265 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms