RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ANTXRLA6NF34 631 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SLC2A10O95528 541 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MT-ND5P03915 603 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CMPK1P30085 196 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 HAAOP46952 286 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RFX3P48380 749 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 PDX1P52945 283 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TAS2R43P59537 309 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SHC2P98077 582 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 INSL4Q14641 139 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 DEFB115Q30KQ5 88 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 VASNQ6EMK4 673 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CDK20Q8IZL9 346 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 KAT2AQ92830 837 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 PHF21AQ96BD5 680 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SLC35A4Q96G79 324 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ART5Q96L15 291 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CITED4Q96RK1 184 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ABCG5Q9H222 651 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 WDR45Q9Y484 360 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.1□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SZT2Q5T011 3432 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TRAV6A0A075B6T7 132 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FAM183AA6NL82 134 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 J3QRE1 110 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 AKR7A2O43488 359 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NTN1O95631 604 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 HK1P19367 917 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CAPZA2P47755 286 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 P2RX3P56373 397 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MESP2Q0VG99 397 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 LRRC32Q14392 662 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NIPAL3Q6P499 406 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CORO6Q6QEF8 472 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 LUZP2Q86TE4 346 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 GHDCQ8N2G8 530 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 OR5W2Q8NH69 310 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FANK1Q8TC84 345 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CD180Q99467 661 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NDC1Q9BTX1 674 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TEX101Q9BY14 249 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 PIGUQ9H490 435 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CACNG2Q9Y698 323 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NUMA1Q14980 2115 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 C4orf51C9J302 202 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FCMRO60667 390 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RFPL3O75679 317 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RCBTB2O95199 551 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ASGR2P07307 311 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ACRP10323 421 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 NPR2P20594 1047 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 AHCYP23526 432 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 STOMP27105 288 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 EVI2BP34910 448 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 OR3A3P47888 321 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ERVK-21P61565 698 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 BTN3A2P78410 334 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 CEBPEQ15744 281 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 ARL9Q6T311 187 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 OAFQ86UD1 273 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.09□□□□□ -1.11
PKP4-210ENST00000480171 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms