RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 A8MXE2 369 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C9JVG2 144 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EBAG9O00559 213 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SNPHO15079 494 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EMC8O43402 210 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SCO2O43819 266 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ABCB7O75027 752 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ICOSLGO75144 302 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 KCNH1O95259 989 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GABRA3P34903 492 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PSPHP78330 225 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PRR5P85299 388 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PSG6Q00889 435 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 STX5Q13190 355 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TP53BP2Q13625 1128 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EFR3AQ14156 821 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ACKR1Q16570 336 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 VPS26BQ4G0F5 336 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 AGKQ53H12 422 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FNDC7Q5VTL7 733 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 P4HA3Q7Z4N8 544 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR9I1Q8NGQ6 314 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PIK3R3Q92569 461 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TUBA1CQ9BQE3 449 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CCDC106Q9BWC9 280 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPR1 153 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GXYLT2A0PJZ3 443 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NR5A2O00482 541 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN2O60636 221 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UBOX5O94941 541 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PSMG1O95456 288 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ALOX5P09917 674 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FRKP42685 505 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PRIM2P49643 509 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CLDN8P56748 225 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UFM1P61960 85 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FOXF2Q12947 444 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DCST1Q5T197 706 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR5M10Q6IEU7 315 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TREML1Q86YW5 311 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 COX18Q8N8Q8 333 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR4A15Q8NGL6 344 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR5P2Q8WZ92 322 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLC35A4Q96G79 324 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C16orf58Q96GQ5 468 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB18Q99592 522 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GSX2Q9BZM3 304 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR2B2Q9GZK3 357 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CXorf56Q9H5V9 222 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CXorf36Q9H7Y0 433 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FANCFQ9NPI8 374 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SERHLQ9NQF3 203 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MRGBPQ9NV56 204 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.54□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ZANQ9Y493 2812 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ERICH4A6NGS2 130 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GMFGO60234 142 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A3O75751 556 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ACP2P11117 423 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CRYGSP22914 178 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SRD5A2P31213 254 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EVI2BP34910 448 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CD79BP40259 229 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PTGDSP41222 190 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CLK3P49761 638 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PNLIPRP2P54317 469 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SRYQ05066 204 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.53□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD46Q86W74 232 aa10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms