RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 CCR6P51684 374 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BDH1Q02338 343 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf40Q86WS4 652 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC01555Q8NAE3 123 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGXQ8TBF5 258 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP1Q8WWP7 306 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 OSTF1Q92882 214 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 YIPF5Q969M3 257 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FCRL4Q96PJ5 515 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MAB21L2Q9Y586 359 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAH14Q0VDD8 3507 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 J3QRE1 110 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PIP5K1CO60331 668 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PEPDP12955 493 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM27D1Q5T7N8 215 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 NRMQ8IXM6 262 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 RBCK1Q9BYM8 510 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 GSX2Q9BZM3 304 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC38A1Q9H2H9 487 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BABAM2Q9NXR7 383 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 COPZ2Q9P299 210 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM5Q9Y2B1 443 aa17.07■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 USP34Q70CQ2 3546 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PPL8 197 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 VEGFDO43915 354 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SDHBP21912 280 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ST8SIA6P61647 398 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CSNK1G2P78368 415 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ST3GAL3Q11203 375 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFPM2Q8WW38 1151 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf66Q96MD2 445 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TBX5Q99593 518 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 MED17Q9NVC6 651 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 RDH8Q9NYR8 311 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG4BQ9Y4P1 393 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JK05 382 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 LRIT2A6NDA9 550 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 G3V3Q6 166 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SSNA1O43805 119 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PRNPP04156 253 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 THY1P04216 161 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ADRB3P13945 408 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DRD2P14416 443 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZP1P60852 638 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DPTQ07507 201 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP19Q14CB8 494 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 PGGHGQ32M88 737 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BHLHB9Q6PI77 547 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CPOQ8IVL8 374 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 NXPE3Q969Y0 559 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TIMP4Q99727 224 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 LGR4Q9BXB1 951 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX12Q9BXU0 123 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 IL20Q9NYY1 176 aa17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PR48 441 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC42EP2O14613 210 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 UGT2B7P16662 529 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 AHRP35869 848 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 STAT5AP42229 794 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 RAG2P55895 527 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DGCR2P98153 550 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 GNA13Q14344 377 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 GARNL3Q5VVW2 1013 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 WBP1Q96G27 269 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7D2Q96RA2 312 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGDIGQ99819 225 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM168Q9H0V1 697 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 RWDD3Q9Y3V2 267 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 NPTNQ9Y639 398 aa17.05■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FCMRO60667 390 aa17.04■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 FPR3P25089 353 aa17.04■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 DHCR24Q15392 516 aa17.04■□□□□ 0.32
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms