RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLIPR2Q9H4G4 154 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 OCEL1Q9H607 264 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 GGT1P19440 569 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABRA3P34903 492 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MSMPQ1L6U9 139 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 AWAT1Q58HT5 328 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRR31Q5SQ13 230 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 MROH9Q5TGP6 573 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAGE2Q7Z2X7 111 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF195O14628 629 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYTIPO60759 359 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNK2O95069 426 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 STAMBPO95630 424 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 FESP07332 822 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CELA3BP08861 270 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARAFP10398 606 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRKCAP17252 672 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PGCP20142 388 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNF1AP20823 631 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
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