RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 UGT2B10P36537 528 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TGFBR1P36897 503 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NDUFA9Q16795 377 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM201Q5SNT2 666 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf189Q5VU69 101 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DCDC5Q6ZRR9 648 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.68□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FCMRO60667 390 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ADRA2AP08913 450 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ALOX12P18054 663 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ALAS2P22557 587 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TUBA1BP68363 451 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TCTE1Q5JU00 501 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC73Q6P1J9 531 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TUBA1AQ71U36 451 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 S100ZQ8WXG8 99 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NR4A3Q92570 626 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MS4A4EQ96PG1 132 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GPA33Q99795 319 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NDC1Q9BTX1 674 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRY4Q9C004 299 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 LYRM4Q9HD34 91 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 HMG20AQ9NP66 347 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DKK4Q9UBT3 224 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 RAXQ9Y2V3 346 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.67□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TAF4O00268 1085 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 RAD1O60671 282 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP7B1O75881 506 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DLGAP3O95886 979 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 AGR2O95994 175 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 RGS6P49758 472 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R41P59536 307 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ARPC4P59998 168 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OLR1P78380 273 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.066e-10■□□□□ 11.1
TSNARE1-201ENST00000307180 GRM7Q14831 915 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2L13Q8N349 312 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CDS1Q92903 461 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 SCN2AQ99250 2005 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A087WUU8 490 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 HYKKA2RU49 373 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF860A6NHJ4 632 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 FRS3O43559 492 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 MED26O95402 600 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 HSMCR30P0CW71 290 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 LIPCP11150 499 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CPMP14384 443 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GSTM3P21266 225 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 CD82P27701 267 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKAR1BP31321 381 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GIPRP48546 466 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 ITGADQ13349 1161 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 GINS1Q14691 196 aa14.66□□□□□ -0.06
TSNARE1-201ENST00000307180 NCF4Q15080 339 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms