RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303004.4

CEBPB-201, Transcript of CCAAT enhancer binding protein beta, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CEBPB, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPB-201ENST00000303004 ARHGEF9O43307 516 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 CHRNB1P11230 501 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 CPMP14384 443 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 HK1P19367 917 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 NPR2P20594 1047 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 HTR2AP28223 471 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 MADCAM1Q13477 382 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 OR1Q1Q15612 314 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 IDNKQ5T6J7 187 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 SLC43A2Q8N370 569 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 TMEM99Q8N816 258 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 TEX19Q8NA77 164 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 OR2M4Q96R27 311 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 STACQ99469 402 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 DAPP1Q9UN19 280 aa22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 TNFSF14O43557 240 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 PLOD3O60568 738 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 AK1P00568 194 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 MAKP20794 623 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 THBS2P35442 1172 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 WASP42768 502 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 MAB21L1Q13394 359 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 WDR88Q6ZMY6 472 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 SPRED2Q7Z698 418 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 CDK20Q8IZL9 346 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 OR4E2Q8NGC2 313 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 COL26A1Q96A83 441 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 CLDND1Q9NY35 253 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 HAO2Q9NYQ3 351 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 BAIAP2Q9UQB8 552 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.08■■□□□ 1.13
CEBPB-201ENST00000303004 A0A0G2JMP0 313 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 A0A0X1KG70 313 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 CDHR4A6H8M9 788 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 B3GALT2O43825 422 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 KIR2DS3Q14952 304 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PXKQ7Z7A4 578 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 RFT1Q96AA3 541 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 LYRM4Q9HD34 91 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 MYO7AQ13402 2215 aa22.08■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 TBC1D3EA0A087X179 549 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SC5DO75845 299 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 IFI30P13284 250 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PRKCAP17252 672 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ACSL1P33121 698 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 FOXK2Q01167 660 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 GALK2Q01415 458 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 GPR68Q15743 365 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 DCST2Q5T1A1 773 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SLC37A3Q8NCC5 494 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 OR2A5Q96R48 311 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 FGF22Q9HCT0 170 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 POLE3Q9NRF9 147 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PRSS38A1L453 326 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 BTN3A3O00478 584 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 ATP1B1P05026 303 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PITPNBP48739 271 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 GNG2P59768 71 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 RUNX2Q13950 521 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 GPR176Q14439 515 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 MAPK14Q16539 360 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PLA1AQ53H76 456 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PFN4Q8NHR9 129 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PTP4A1Q93096 173 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 TEAD3Q99594 435 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 WACQ9BTA9 647 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.07■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 LAMP2P13473 410 aa22.06■■□□□ 1.12
CEBPB-201ENST00000303004 PRG2P13727 222 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms