RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274170.8

CDH18-201, Transcript of cadherin 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDH18, Length 2,809 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-201ENST00000274170 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 FANCFQ9NPI8 374 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 COA4Q9NYJ1 87 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SSR3Q9UNL2 185 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.2□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 PRSS47A8MTI9 375 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 PRSS56P0CW18 603 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ANXA3P12429 323 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ANXA8P13928 327 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 EVX1P49640 407 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MXD1Q05195 221 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 IL11RAQ14626 422 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ETFDHQ16134 617 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SVIPQ8NHG7 77 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 YIPF5Q969M3 257 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GPR21Q99679 349 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NPAS1Q99742 590 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MED28Q9H204 178 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CHST8Q9H2A9 424 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 PPT2Q9UMR5 302 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SLC28A1O00337 649 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RGS14O43566 566 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RPN2P04844 631 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 BCKDHAP12694 445 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CPEP16870 476 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GPX2P18283 190 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CXCL3P19876 107 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 AOAHP28039 575 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 LIMS1P48059 325 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CLDN8P56748 225 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 DSG2Q14126 1118 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 TOMM20Q15388 145 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 BICRALQ6AI39 1079 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 DTX1Q86Y01 620 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SARGQ9BW04 601 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MND1Q9BWT6 205 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 NPTNQ9Y639 398 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ISM1B1AKI9 464 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 TNFRSF11BO00300 401 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RRP8O43159 456 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MPZL2O60487 215 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SELENOFO60613 162 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 MTX2O75431 263 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CBSLP0DN79 551 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 FGF5P12034 268 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 STOMP27105 288 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 SDC2P34741 201 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 CBSP35520 551 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ZNF81P51508 661 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RAB14P61106 215 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 HMGCS1Q01581 520 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GTF2H2Q13888 395 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 VEZF1Q14119 521 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GPR18Q14330 331 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GPR176Q14439 515 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 RRM2BQ7LG56 351 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 ANKRD46Q86W74 232 aa7.19□□□□□ -1.26
CDH18-201ENST00000274170 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms