RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MTFR2Q6P444 385 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SFXN2Q96NB2 322 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HHATLQ9HCP6 504 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MED17Q9NVC6 651 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HCRTR2O43614 444 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DNAJA2O60884 412 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LINGO3P0C6S8 592 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GLI4P10075 376 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GABRA1P14867 456 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PGM1P36871 562 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 P2RX1P51575 399 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 NUP107P57740 925 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DSTNP60981 165 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FGFBP1Q14512 234 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PLPPR5Q32ZL2 321 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 C1orf185Q5T7R7 199 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRGQ86SM5 289 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF614Q8N883 585 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FAM71CQ8NEG0 241 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 POC1BQ8TC44 478 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GPR119Q8TDV5 335 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 OIT3Q8WWZ8 545 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 VDAC3Q9Y277 283 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DSPPQ9NZW4 1301 aa20.15■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 AGAP5A6NIR3 686 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CLDN24A6NM45 220 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZNF264O43296 627 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TOXO94900 526 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 NR2F1P10589 423 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZNF708P17019 499 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GPX2P18283 190 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PMPCAQ10713 525 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 FADDQ13158 208 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SKP2Q13309 424 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 BCL2A1Q16548 175 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 AAGABQ6PD74 315 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MAL2Q969L2 176 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 LAT2Q9GZY6 243 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.14■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 A0A087WZY1 265 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 C7orf72A4D263 438 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 H3BNH8 94 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EPPINO95925 133 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ADRM1Q16186 407 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RAET1LQ5VY80 246 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TMEM211Q6ICI0 200 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ENPP6Q6UWR7 440 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 RPTNQ6XPR3 784 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EID3Q8N140 333 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ZPLD1Q8TCW7 415 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ARSGQ96EG1 525 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TMEM19Q96HH6 336 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CGREF1Q99674 301 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PIGQQ9BRB3 760 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ARMCX1Q9P291 453 aa20.13■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GMNCA6NCL1 334 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 H0YC42 278 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ANGPT2O15123 496 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EFNA2O43921 213 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ADAM11O75078 769 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 BCHEP06276 602 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 UBL4AP11441 157 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 AGAP20933 346 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PTGER4P35408 488 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 GNGT1P63211 74 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ10P78508 379 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SELPLGQ14242 412 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SPATA21Q7Z572 469 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 OR5W2Q8NH69 310 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 PMM1Q92871 262 aa20.12■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD27Q96NW4 1050 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms