RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634931.1

SMARCA2-231, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SMARCA2, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-231	ENST00000634931	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR4A16	Q8NH70	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DYRK2	Q92630	601 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FGF11	Q92914	225 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	EPYC	Q99645	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PKP2	Q99959	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	MMP28	Q9H239	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CARD9	Q9H257	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRORY	Q9H606	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HACD3	Q9P035	362 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	RP1	P56715	2156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		E9PAM4	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		F5H5T6	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931		K7ERQ8	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LAT	O43561	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LMX1B	O60663	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NEBL	O76041	1014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPM3	P06753	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCKAR	P32238	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DRD3	P35462	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC1A3	P43003	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	RABIF	P47224	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DLX5	P56178	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	STX17	P56962	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DCDC1	P59894	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TPM4	P67936	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PHEX	P78562	749 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NME3	Q13232	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	DEFB106A	Q8N104	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CALN1	Q9BXU9	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCA2-231	ENST00000634931	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SLC28A1	O00337	649 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MCF2L	O15068	1137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	YKT6	O15498	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	SNAP91	O60641	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CYTIP	O60759	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	B4GALT1	P15291	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACP1	P24666	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CCR1	P32246	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	CHRNA3	P32297	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCA2-231	ENST00000634931	ACADSB	P45954	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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