RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622814.4

IRX4-208, Transcript of iroquois homeobox 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRX4, Length 2,398 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRX4-208	ENST00000622814	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	FRMD1	Q8N878	549 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	SMIM10	Q96HG1	83 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	STARD5	Q9NSY2	213 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		18.83	■□□□□ 0.61
IRX4-208	ENST00000622814	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NFATC4	Q14934	902 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DCST2	Q5T1A1	773 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SDE2	Q6IQ49	451 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CNIH2	Q6PI25	160 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TEX12	Q9BXU0	123 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	UNC119B	A6NIH7	251 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PLA2G10	O15496	165 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NT5E	P21589	574 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	LSS	P48449	732 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DUSP8	Q13202	625 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ASAH1	Q13510	395 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM99	Q8N816	258 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	FANK1	Q8TC84	345 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	WDR92	Q96MX6	357 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GABRG3	Q99928	467 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ATF6B	Q99941	703 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SLC22A4	Q9H015	551 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	IGHA1	P01876	353 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	IFI30	P13284	250 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SHC2	P98077	582 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR1Q1	Q15612	314 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	BCL2A1	Q16548	175 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	EOGT	Q5NDL2	527 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	FAM3C	Q92520	227 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	AP3S1	Q92572	193 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		18.82	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		H0YGG7	62 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	CT62	P0C5K7	136 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	NDUFS1	P28331	727 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	KIAA1024L	P59773	190 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	KLHL12	Q53G59	568 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	FHL5	Q5TD97	284 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	USP53	Q70EK8	1073 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZAR1	Q86SH2	424 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	BEX2	Q9BXY8	128 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		A0A0B4J293	547 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814		A6NL46	340 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	REM1	O75628	298 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	KIR2DL3	P43628	341 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	KIR2DS3	Q14952	304 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	COX18	Q8N8Q8	333 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	GRHL3	Q8TE85	626 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RNF31	Q96EP0	1072 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	RNF32	Q9H0A6	362 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	PIGU	Q9H490	435 aa		18.81	■□□□□ 0.6
IRX4-208	ENST00000622814	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		18.81	■□□□□ 0.6

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