RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 HSPA12AO43301 675 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TGM5O43548 720 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SC5DO75845 299 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARAFP10398 606 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARSBP15848 533 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GJA5P36382 358 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM46BQ96A09 425 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNX18Q96RF0 628 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NME7Q9Y5B8 376 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LAMB2P55268 1798 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 UGDHO60701 494 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAB3DO95716 219 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHRNB1P11230 501 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 HLA-DMAP28067 261 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 BPIFA2Q96DR5 249 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLAMF7Q9NQ25 335 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TAPBPO15533 448 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ICMTO60725 284 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARHGEF15O94989 841 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD34P28906 385 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 HLA-FP30511 346 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TGM4P49221 684 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 P2RY14Q15391 338 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C18orf63Q68DL7 685 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FCRLAQ7L513 359 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRRC1Q96M27 445 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.12□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2A25A4D2G3 310 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PPM1BO75688 479 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFB2O95178 105 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FUT1P19526 365 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SGCBQ16585 318 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SGCAQ16586 387 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDS1Q92903 461 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RGCCQ9H4X1 137 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LHX3Q9UBR4 397 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KNG1P01042 644 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 UBXN2BQ14CS0 331 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GALNT7Q86SF2 657 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXL2Q9UKC9 423 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TNFP01375 233 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 IMPA1P29218 277 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR143P51810 404 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAPQ12884 760 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARSKQ6UWY0 536 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 APOOLQ6UXV4 268 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 USP53Q70EK8 1073 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR4K17Q8NGC6 315 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM184CQ9NVA4 438 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 RNF186Q9NXI6 227 aa13.11□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A0A6YYH2 397 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 A6NJ64 397 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC1A3P43003 542 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIAA1211LQ6NV74 962 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD163Q86VB7 1156 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2T4Q8NH00 348 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC7A6Q92536 515 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARSGQ96EG1 525 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 CXorf36Q9H7Y0 433 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 NOX3Q9HBY0 568 aa13.1□□□□□ -0.31
RPS6KC1-208ENST00000614059 STARD5Q9NSY2 213 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms