RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	VPS33A	Q96AX1	596 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	ROPN1L	Q96C74	230 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NEURL4-208	ENST00000572680	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HCRTR2	O43614	444 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GUSB	P08236	651 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PEPD	P12955	493 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	COL8A1	P27658	744 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MAGEA8	P43361	318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	STAR	P49675	285 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LHX2	P50458	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HPCA	P84074	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SRY	Q05066	204 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SQLE	Q14534	574 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CD226	Q15762	336 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	GPAT3	Q53EU6	434 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZFP90	Q8TF47	636 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LIPT1	Q9Y234	373 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	VDAC3	Q9Y277	283 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	WDR45	Q9Y484	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0G2JND7	137 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OR2M5	A3KFT3	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HSPB2	A8KAH6	182 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HMGN4	O00479	90 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NR5A2	O00482	541 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FCMR	O60667	390 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	IL2RA	P01589	272 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF708	P17019	499 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	TIMP3	P35625	211 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	P2RX1	P51575	399 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CDSN	Q15517	529 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF141	Q15928	474 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	HSPB2	Q16082	182 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	AGK	Q53H12	422 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ARSK	Q6UWY0	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		Q9UFV3	132 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	SERINC4	A6NH21	518 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680		H3BML4	177 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF264	O43296	627 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	KIAA0513	O60268	411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	NUDT14	O95848	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	C1QC	P02747	245 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	UBL4A	P11441	157 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF17	P17021	662 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ADH7	P40394	386 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	CLDN18	P56856	261 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	ZNF117	Q03924	483 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	COX20	Q5RI15	118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NEURL4-208	ENST00000572680	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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