RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SPATA19Q7Z5L4 167 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 BTLAQ7Z6A9 289 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MARCH3Q86UD3 253 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FNDC5Q8NAU1 212 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EGLN2Q96KS0 407 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PIGMQ9H3S5 423 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GLIPR2Q9H4G4 154 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SAR1AQ9NR31 198 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 AIG1Q9NVV5 245 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SIRT5Q9NXA8 310 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ASIC5Q9NY37 505 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EDARQ9UNE0 448 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TESMINQ9Y4I5 508 aa11.39□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OR2M5A3KFT3 312 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A20A6NK97 555 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 H3BML4 177 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1D-16P01601 117 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 BCKDHAP12694 445 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 HOXC12P31275 282 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CCKARP32238 428 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NOXRED1Q6NXP6 359 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 APOOLQ6UXV4 268 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF550Q7Z398 422 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GALNT10Q86SR1 603 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SMPDL3BQ92485 455 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 AMDHD1Q96NU7 426 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PIGQQ9BRB3 760 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PINK1Q9BXM7 581 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MYNNQ9NPC7 610 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EQTNQ9NQ60 294 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MIEF1Q9NQG6 463 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 TMED5Q9Y3A6 229 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 HEATR5AQ86XA9 2040 aa11.38□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WV62 115 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MSTNO14793 375 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CASKO14936 926 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 COQ9O75208 318 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DCTN3O75935 186 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PSMG1O95456 288 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 G6PDP11413 515 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PEPDP12955 493 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SDC1P18827 310 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GABRA3P34903 492 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ATP4BP51164 291 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 SQLEQ14534 574 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 BCL2A1Q16548 175 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 OR2L13Q8N349 312 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PIK3R3Q92569 461 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ELP4Q96EB1 424 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NPAS1Q99742 590 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ARMCX1Q9P291 453 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD28O15084 1053 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CCDC22O60826 627 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GOSR1O95249 250 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 UTS2O95399 124 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IL33O95760 270 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CGAP01215 116 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PRPS2P11908 318 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 IDO1P14902 403 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 FOSL1P15407 271 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MAPK1P28482 360 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NTSP30990 170 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 CD79BP40259 229 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 HSPB3Q12988 150 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 PON3Q15166 354 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 DECR1Q16698 335 aa11.36□□□□□ -0.59
PRAME-212ENST00000485532 GSTA3Q16772 222 aa11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms