RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481739.1

RXRA-202, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RXRA, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-202ENST00000481739 CLPXO76031 633 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CD36P16671 472 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DRD5P21918 477 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SERPINB10P48595 397 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 EFNB1P98172 346 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 MAPK14Q16539 360 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 D2HGDHQ8N465 521 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 IL20Q9NYY1 176 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 M0R129 80 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 FLRT2O43155 660 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 DYRK3O43781 588 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ZNF806P0C7X5 589 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TGFBR2P37173 567 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RHAGQ02094 409 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SPEM2Q0P670 501 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SQSTM1Q13501 440 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 AQP6Q13520 282 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 MOGQ16653 247 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TMEM163Q8TC26 289 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 TMEM80Q96HE8 168 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 GPA33Q99795 319 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 28.3
RXRA-202ENST00000481739 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.59□□□□□ -0.07
RXRA-202ENST00000481739 SCN2AQ99250 2005 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 H3BMH7 237 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 M0R3G1 203 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 PEX12O00623 359 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 MAN1A2O60476 641 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 FOLR1P15328 257 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TUBA1BP68363 451 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF91Q05481 1191 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SPCS2Q15005 226 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 OR1Q1Q15612 314 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF141Q15928 474 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SNAPC1Q16533 368 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TUBA1AQ71U36 451 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 NRMQ8IXM6 262 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 GPR135Q8IZ08 494 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SELENONQ9NZV5 590 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 KCNE5Q9UJ90 142 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 CFL2Q9Y281 166 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.58□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 PRODHO43272 600 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 THY1P04216 161 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 DGUOKQ16854 277 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 KLHL22Q53GT1 634 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SYT14P1Q58G82 188 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 ZNF550Q7Z398 422 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 KIF18BQ86Y91 864 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 SLC43A2Q8N370 569 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TRIM2Q9C040 744 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 PALMDQ9NP74 551 aa14.57□□□□□ -0.08
RXRA-202ENST00000481739 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms