RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FZD5Q13467 585 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 UTS2BQ765I0 119 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ACOT12Q8WYK0 555 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 HS6ST2Q96MM7 605 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 KCNN2Q9H2S1 579 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MALT1Q9UDY8 824 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SLC22A7Q9Y694 548 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 C12orf71A8MTZ7 269 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 P2RX6O15547 441 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TNFSF14O43557 240 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 STX11O75558 287 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PTNP21246 168 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CDK10Q15131 360 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 P2RY14Q15391 338 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ENPP7Q6UWV6 458 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 UBE2J2Q8N2K1 259 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM239Q8WW34 195 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 BABAM2Q9NXR7 383 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 BMP7P18075 431 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 HTR2AP28223 471 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 INSL4Q14641 139 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 OR1Q1Q15612 314 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK14Q16539 360 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DCST2Q5T1A1 773 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FHL5Q5TD97 284 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ALG8Q9BVK2 526 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SATB2Q9UPW6 733 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 A0A0B4J293 547 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 POM121BA6NF01 834 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 BHLHE40O14503 412 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PRG2P13727 222 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PPP2CBP62714 309 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PPP2CAP67775 309 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TCEA2Q15560 299 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 UBASH3BQ8TF42 649 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ASB12Q8WXK4 309 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NACC2Q96BF6 587 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 RNF31Q96EP0 1072 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM43Q9BTV4 400 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 IFI30P13284 250 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 NID1P14543 1247 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MAKP20794 623 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MTNR1BP49286 362 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 FXYD6P3P58550 94 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 SMARCD3Q6STE5 483 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ABHD13Q7L211 337 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 LNX2Q8N448 690 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP18Q8NEJ0 188 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 ADAP2Q9NPF8 381 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXD13-201ENST00000392539 GRXCR1A8MXD5 290 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 RFXAPO00287 272 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 CTSVO60911 334 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 RCBTB2O95199 551 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 NTSR1P30989 418 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 WDR88Q6ZMY6 472 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 NOXA1Q86UR1 476 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 PFN4Q8NHR9 129 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 LYRM4Q9HD34 91 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 FAM86C2PA6NEL3 165 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 FMO6PO60774 539 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJB6O75190 326 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 LYPD3O95274 346 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 YES1P07947 543 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 GKN3PP0CG01 181 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 UGT2B7P16662 529 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 NFATC4Q14934 902 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 SDE2Q6IQ49 451 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 FIGLAQ6QHK4 219 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 RD3Q7Z3Z2 195 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 CDK20Q8IZL9 346 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 RNF170Q96K19 258 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 MED20Q9H944 212 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 INPP5EQ9NRR6 644 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP22Q9NRW4 184 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM5Q9Y2B1 443 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf42Q9H799 3197 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms