RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 GPATCH2Q9NW75 528 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TAS2R7Q9NYW3 318 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 COL4A6Q14031 1691 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 POM121BA6NF01 834 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 H0Y8X5 98 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SGK494L7N484 410 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRMT3O60678 531 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAP00813 363 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFS1P28331 727 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC6A1P30531 599 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CAPZA2P47755 286 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PNLIPRP1P54315 467 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RIN1Q13671 783 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GRM7Q14831 915 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 QSOX2Q6ZRP7 698 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2L2Q8NH16 312 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LMX1AQ8TE12 382 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC38A3Q99624 504 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 KLHL42Q9P2K6 505 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CMPK1P30085 196 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 DRD3P35462 400 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HSD17B2P37059 387 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CD79BP40259 229 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 BTG1P62324 171 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC9A5Q14940 896 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM40Q6P9F5 258 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNJ15Q99712 375 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LGR4Q9BXB1 951 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX12Q9BXU0 123 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 H7BY64 318 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LGALS8O00214 317 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PLATP00750 562 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SPTBP11277 2137 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ITPKBP27987 946 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PGDP52209 483 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 LIM2P55344 173 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP2CBP62714 309 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RPS26P62854 115 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP2CAP67775 309 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CTAG1AP78358 180 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PUDPQ08623 228 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GINS1Q14691 196 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM107Q6UX40 140 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ART5Q96L15 291 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HSPA12BQ96MM6 686 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAP2Q9NPF8 381 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SDHAF2Q9NX18 166 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 CACNG2Q9Y698 323 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 ALPK3Q96L96 1907 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 COL9A1P20849 921 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GIFP27352 417 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RABIFP47224 123 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TSPAN5P62079 268 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 DPTQ07507 201 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC5A12Q1EHB4 618 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SYT14P1Q58G82 188 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR135Q8IZ08 494 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 RNFT2Q96EX2 444 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 MED18Q9BUE0 208 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 IFT46Q9NQC8 304 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 BTNL2Q9UIR0 455 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 HRH3Q9Y5N1 445 aa10.46□□□□□ -0.73
RPRD1B-201ENST00000373433 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 RGS11O94810 467 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 PTGER1P34995 402 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 DSTNP60981 165 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 B4GALNT1Q00973 533 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 MC1RQ01726 317 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 ILKQ13418 452 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF385BQ569K4 471 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.46□□□□□ -0.74
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms