RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HAS3O00219 553 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 GIFP27352 417 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PBX2P40425 430 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HCCSP53701 268 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC17A1Q14916 467 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 DPEP3Q9H4B8 488 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 RHCGQ9UBD6 479 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 VNN1O95497 513 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SORDQ00796 357 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ABHD15Q6UXT9 468 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 OR9A1PQ8NGU1 263 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 LYSMD1Q96S90 227 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MOB1AQ9H8S9 216 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MRC1P22897 1456 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 M0R2N6 131 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 GPR157Q5UAW9 335 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 NOXRED1Q6NXP6 359 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 FBXO8Q9NRD0 319 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PMS2P2O95744 297 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 FGF4P08620 206 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 FEVQ99581 238 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 P2RY13Q9BPV8 354 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 STRA6Q9BX79 667 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PINK1Q9BXM7 581 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV20A0A0B4J274 112 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PDHXO00330 501 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINE2P07093 398 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 CD9P21926 228 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 DDIT4LQ96D03 193 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM212A6NML5 194 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2F2O95006 317 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ALPLP05186 524 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ARSBP15848 533 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNA4P43681 627 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFV1P49821 464 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 OR2F1Q13607 317 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PPA1Q15181 289 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf38Q5JPI3 329 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SSX7Q7RTT5 188 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB3DO95716 219 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 GSRP00390 522 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 BDKRB1P46663 353 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ERVK-21P61565 698 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TAF10Q12962 218 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 DBF4BQ8NFT6 615 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ALG8Q9BVK2 526 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPB2A8KAH6 182 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 FABP7O15540 132 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TK1P04183 234 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 DAOAP59103 153 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TEKQ02763 1124 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 INCA1Q0VD86 236 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPB2Q16082 182 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MTURNQ8N3F0 131 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM125Q96AQ2 219 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms