RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF32Q9H0A6 362 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLIT3O75094 1523 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV18A0A075B6X5 111 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A2P31639 672 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ERVPABLB-1P60509 514 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SPOCK1Q08629 439 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FAPQ12884 760 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF674Q2M3X9 581 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ADIPOR2Q86V24 386 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PDSS2Q86YH6 399 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ACOT4Q8N9L9 421 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OLAHQ9NV23 265 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SCML1Q9UN30 329 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10A5Q9H207 317 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR10A2Q9H208 303 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RGCCQ9H4X1 137 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF225Q9UK10 706 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DUOX1Q9NRD9 1551 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 H0Y8X5 98 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CLN5O75503 358 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MAOAP21397 527 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CD79BP40259 229 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TGFBR3Q03167 851 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 EFR3AQ14156 821 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM189A2Q15884 450 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ULBP2Q9BZM5 246 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LANCL2Q9NS86 450 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 KCND1Q9NSA2 647 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NDUFAF4Q9P032 175 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A096LPI6 279 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LGALS8O00214 317 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GFRA2O00451 464 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRTM2O43300 516 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFSF15O95150 251 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DAP3P51398 398 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF81P51508 661 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2A12Q8NGT7 310 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 GTF2H4Q92759 462 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC16A7O60669 478 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DDAH2O95865 285 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM163BP0C2L3 166 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CPMP14384 443 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DRD2P14416 443 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DRD5P21918 477 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HTR6P50406 440 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NGBQ9NPG2 151 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 IL26Q9NPH9 171 aa11.16□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 KLF11O14901 512 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TFPTP0C1Z6 253 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 DUSP2Q05923 314 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NADK2Q4G0N4 442 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 M0R1B8 84 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MITFO75030 526 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SEC14L2O76054 403 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 RING1Q06587 406 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SERTAD2Q14140 314 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SFT2D3Q587I9 215 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2T4Q8NH00 348 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 NETO1Q8TDF5 533 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ETAA1Q9NY74 926 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 ABCC6O95255 1503 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 B4GAT1O43505 415 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC35E2BP0CK96 405 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKAR1BP31321 381 aa11.15□□□□□ -0.62
UBASH3B-201ENST00000284273 IDUAP35475 653 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 165.3 ms