RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 CALML5Q9NZT1 146 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 CARNS1A5YM72 827 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 LINC00862A6NCI5 91 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 PCCBP05166 539 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 SLC35G4P0C7Q5 338 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 F8A1P23610 371 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 CERS1P27544 350 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 FXYD6P3P58550 94 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 CDK3Q00526 305 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 LTB4RQ15722 352 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 CDC73Q6P1J9 531 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 TTLQ8NG68 377 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 CXorf40AQ8TE69 158 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 KAT2AQ92830 837 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 SLC35A4Q96G79 324 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 LRRC3BQ96PB8 259 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 OR52D1Q9H346 318 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 DPAGT1Q9H3H5 408 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SYP-201ENST00000263233 NOTCH4Q99466 2003 aa13.9□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 DAPL1A0PJW8 107 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ADH5P11766 374 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 FUT1P19526 365 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CXCL3P19876 107 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 GALEQ14376 348 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 PYHIN1Q6K0P9 492 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ZNF681Q96N22 645 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ENKD1Q9H0I2 346 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 OR51J1Q9H342 316 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 NARFLQ9H6Q4 476 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 FZD7O75084 574 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 TCRBP04435 133 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ANXA3P12429 323 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 M6PRP20645 277 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 MPIP34949 423 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CLDN2P57739 230 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 E2F1Q01094 437 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 AGERQ15109 404 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 DPH1Q9BZG8 443 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 AUP1Q9Y679 476 aa13.89□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 PRR23AA6NEV1 266 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 BTN3A3O00478 584 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 PLPP2O43688 288 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 REM1O75628 298 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 RAF1P04049 648 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 TPOP07202 933 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CD276Q5ZPR3 534 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CEACAM19Q7Z692 300 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 OR8H3Q8N146 312 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ABHD4Q8TB40 342 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 MARVELD3Q96A59 401 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ARMC5Q96C12 935 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 C12orf66Q96MD2 445 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 SYNPO2LQ9H987 977 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 GLTPQ9NZD2 209 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 LTBP2Q14767 1821 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 UNC119BA6NIH7 251 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 HIDE1A8MVS5 230 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 BHLHE40O14503 412 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 FGF19O95750 216 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 SYPP08247 313 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CD3GP09693 182 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC3A1Q07837 685 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 CEBPEQ15744 281 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 HACD4Q5VWC8 232 aa13.88□□□□□ -0.19
SYP-201ENST00000263233 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms