RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2J2O76002 312 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SAXO2Q658L1 398 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 C18orf63Q68DL7 685 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 BHLHB9Q6PI77 547 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PQLC1Q8N2U9 271 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5M9Q8NGP3 310 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 BBS4Q96RK4 519 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TTYH2Q9BSA4 534 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 LIME1Q9H400 295 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0G2JNJ9 132 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GVC2 190 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 DHRS12A0PJE2 317 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCR6O00574 342 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CYR61O00622 381 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GLI4P10075 376 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVR2AP27037 513 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ADRM1Q16186 407 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZZZ3Q8IYH5 903 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SFXN5Q8TD22 340 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RASL10BQ96S79 203 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOTQ9UBF9 498 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 Q9UFV3 132 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA2Q9BZC7 2435 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF21O75509 655 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CTAG2O75638 210 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFAND5O76080 213 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK5O94991 958 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ADH7P40394 386 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX3P41225 446 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB38P57729 211 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXO1Q12778 655 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MYBPHQ13203 477 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP51A1Q16850 503 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PTOV1Q86YD1 416 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM251Q8N6I4 163 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 PIF1Q9H611 641 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NTMQ9P121 344 aa22.09■■□□□ 1.13
CAPNS1-216ENST00000628306 A8MVJ9 347 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 G3V3Y1 287 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 BAG2O95816 211 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CELA3AP09093 270 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B7P56937 341 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TRILQ7L0X0 811 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf111Q8N326 155 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf65Q8NCR3 313 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf57Q8NEG2 295 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 UCN3Q969E3 161 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT2B28Q9BY64 529 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 DLL4Q9NR61 685 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HPF1Q9NWY4 346 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 USP22Q9UPT9 525 aa22.08■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 OR14I1A6ND48 311 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FCGR1AP12314 374 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NCK1P16333 377 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 VHLP40337 213 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF321PQ8N8H1 164 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 NINJ1Q92982 152 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 VCX3BQ9H321 246 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.07■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PLOD2O00469 737 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PCGF2P35227 344 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEA5P43359 124 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ERFP50548 548 aa22.06■■□□□ 1.12
CAPNS1-216ENST00000628306 BIKQ13323 160 aa22.06■■□□□ 1.12
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