RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621665.1

GRAMD4P3-201, Transcript of GRAM domain containing 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene GRAMD4P3, Length 1,669 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4P3-201ENST00000621665 A0A0G2JNJ9 132 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IGKV1D-16P01601 117 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PGRP06401 933 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAGEA8P43361 318 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 WNT3P56703 355 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 STX1BP61266 288 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PPP2R2AP63151 447 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR4C3Q8NH37 302 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCDC115Q96NT0 180 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR52E6Q96RD3 313 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PANX1Q96RD7 426 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 UCN2Q96RP3 112 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RMND5AQ9H871 391 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 Q9UFV3 132 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 UBDO15205 165 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZIC3O60481 467 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DIAPH2O60879 1101 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 STX11O75558 287 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SLC22A3O75751 556 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GUSBP08236 651 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF708P17019 499 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF17P17021 662 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OPRM1P35372 400 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ATP12AP54707 1039 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 POLE3Q9NRF9 147 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.65□□□□□ -0.06
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IL18BPO95998 194 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KHKP50053 298 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LHX2P50458 406 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 UFM1P61960 85 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HPCAP84074 193 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TTMPQ5BVD1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CCNJQ5T5M9 372 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OR2A2Q6IF42 318 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 WNT2BQ93097 391 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NEURL3Q96EH8 262 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FREM3P0C091 2139 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SCN2BO60939 215 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KRT75O95678 551 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CTSSP25774 331 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SSTR2P30874 369 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ADH7P40394 386 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DGKQP52824 942 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SRYQ05066 204 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ANKRD46Q86W74 232 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MIER2Q8N344 545 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 C7orf72A4D263 438 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TOXO94900 526 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ME2P23368 584 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 NME5P56597 212 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms