RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GXYLT2A0PJZ3 443 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2W5A6NFC9 320 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SGK494L7N484 410 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLF4O43474 513 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFSF14O43557 240 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APBB3O95704 486 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZGLP1P0C6A0 271 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC1A3P43003 542 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCGRP47871 477 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSPHP78330 225 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BNC1Q01954 994 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLK5Q496M5 336 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FCRLBQ6BAA4 426 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2J2Q8N2K1 259 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF614Q8N883 585 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OSTF1Q92882 214 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TBX5Q99593 518 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NTMQ9P121 344 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM129A0AVI4 362 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCR1O76036 304 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAKP20794 623 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FXYD6P3P58550 94 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAB2P98082 770 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGGHGQ32M88 737 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DCST2Q5T1A1 773 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLBD1Q6P4A8 553 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX18Q8N8Q8 333 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51G2Q8NGK0 314 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ITPKCQ96DU7 683 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCTD7Q96MP8 289 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KATNB1Q9BVA0 655 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HCAR1Q9BXC0 346 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBQLN3Q9H347 655 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLDND1Q9NY35 253 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLCA2Q9UQC9 943 aa10.97□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNTNA6NMZ2 147 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GABRA3P34903 492 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HTR4Q13639 388 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FHL5Q5TD97 284 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NXNL2Q5VZ03 156 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABHD13Q7L211 337 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GJD3Q8N144 294 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIRT6Q8N6T7 355 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF485Q8NCK3 441 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR2T33Q8NG76 320 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIGUQ9H490 435 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM60AQ9NP50 221 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBLCQ9ULV8 474 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMAHPQ9Y471 501 aa10.96□□□□□ -0.65
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHISA3A0PJX4 238 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYR61O00622 381 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC30A4O14863 429 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5F1O95221 314 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STAT5AP42229 794 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFA1P59665 94 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFA3P59666 94 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP8Q13202 625 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAM15Q13444 863 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPBGQ13641 420 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR1Q1Q15612 314 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRHL3Q8TE85 626 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UFD1Q92890 307 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIRAS2Q96HU8 199 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIPOR3Q96MK2 946 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF649Q9BS31 505 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52D1Q9H346 318 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTGFRNQ9P2B2 879 aa10.96□□□□□ -0.66
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS13AQ96RL7 3174 aa10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.4 ms