RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC197Q8NCU1 140 aa30.2■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RCN3Q96D15 328 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A1Q9H2H9 487 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CALML5Q9NZT1 146 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD1O00168 92 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRM4P08173 479 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFPTP0C1Z6 253 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDX6P30041 224 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNA13Q14344 377 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A5Q8WUX1 472 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DTNAQ9Y4J8 743 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 HRH3Q9Y5N1 445 aa30.19■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF407Q9C0G0 2248 aa30.19■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BCHEP06276 602 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT7P0C024 238 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRISP3P54108 245 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNEQ04844 493 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC39A3Q9BRY0 314 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB127Q9H1M4 99 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNE5Q9UJ90 142 aa30.18■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FREM3P0C091 2139 aa30.18■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PLA2G2AP14555 144 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOGP8Q6NSW7 305 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF614Q8N883 585 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3GL1Q99961 368 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NANOGQ9H9S0 305 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACKR4Q9NPB9 350 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLSCR2Q9NRY7 297 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC13O75165 2243 aa30.17■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf51A8MQB3 221 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZK1Q5T2W1 519 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFRALQ6UXV0 394 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FADS6Q8N9I5 356 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATSQ8NAP1 163 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4K17Q8NGC6 315 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8J3Q8NGG0 315 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB1Q9HAE3 211 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL2Q9UKC9 423 aa30.17■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKUB1A6NFN9 424 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4DXG7 233 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHG3P01860 377 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CELA3AP09093 270 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELPLGQ14242 412 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD226Q15762 336 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM91A1Q658Y4 838 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAL2Q969L2 176 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM19Q96HH6 336 aa30.16■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM38AQ9H6F2 299 aa30.16■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2M3Q8NG83 312 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa30.15■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DSN1Q9H410 356 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGES2Q9H7Z7 377 aa30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAPPC6AO75865 159 aa30.14■■■□□ 2.42
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZG16BQ96DA0 208 aa30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED11Q9P086 117 aa30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSPPQ9NZW4 1301 aa30.14■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLEQ07864 2286 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUSD5O60279 629 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDE9AO76083 593 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSX1P28360 303 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPK14Q16539 360 aa30.13■■■□□ 2.41
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
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