RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522907.5

MSRA-208, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, human

TSL 5

Gene MSRA, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSRA-208	ENST00000522907	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DIO2	Q92813	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RILP	Q96NA2	401 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	STAC	Q99469	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PIGU	Q9H490	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MPDZ	O75970	2070 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907		A8MVJ9	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SUV39H1	O43463	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ASNA1	O43681	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PSPN	O60542	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DPM1	O60762	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ICOSLG	O75144	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	COQ9	O75208	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	SLC25A12	O75746	678 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	KCNK2	O95069	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ZNF205	O95201	554 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	IL33	O95760	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	NGFR	P08138	427 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CHRM4	P08173	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GUSB	P08236	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	COX4I1	P13073	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CYP4B1	P13584	511 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GPX2	P18283	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	GABRA3	P34903	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CASP3	P42574	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MAGEA8	P43361	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CYB561	P49447	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CRYBA2	P53672	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CASP9	P55211	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	STX1B	P61266	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	PRR5	P85299	388 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSRA-208	ENST00000522907	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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