RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 ADAMDEC1O15204 470 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 ADAP00813 363 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 TGFAP01135 160 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 FESP07332 822 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 EVI2BP34910 448 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 SERPINB9P50453 376 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 CDH11P55287 796 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 PSPHP78330 225 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 LGSNQ5TDP6 509 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 C8orf74Q6P047 294 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 APOOLQ6UXV4 268 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZSR9 355 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 MARCH3Q86UD3 253 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 STK32CQ86UX6 486 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 FANCFQ9NPI8 374 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 GLRX2Q9NS18 164 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 SNX6Q9UNH7 406 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa9.9□□□□□ -0.82
RNF4-218ENST00000513284 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SERINC4A6NH21 518 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 H7C417 338 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ABCD4O14678 606 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KIAA0513O60268 411 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 OTCP00480 354 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 IL32P24001 234 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KRT20P35900 424 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 STX5Q13190 355 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 GGTLC2Q14390 218 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 METTL4Q8N3J2 472 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KAT2AQ92830 837 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PHF21BQ96EK2 531 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 CDK15Q96Q40 435 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 BRF2Q9HAW0 419 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.89□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TNFSF11O14788 317 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 DLX3O60479 287 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ESRRBO95718 433 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TUBBP07437 444 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 EDNRAP25101 427 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 IL12BP29460 328 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 NR4A2P43354 598 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 EFNA4P52798 201 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PSG6Q00889 435 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 GUCY2DQ02846 1103 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SPOCK1Q08629 439 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ITGADQ13349 1161 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 CNPY4Q8N129 248 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 MUC15Q8N387 334 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ZNF675Q8TD23 568 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ABHD3Q8WU67 409 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 OSTF1Q92882 214 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KLHL29Q96CT2 875 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PCTPQ9UKL6 214 aa9.88□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TMEM89A2RUT3 159 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 OR7A17O14581 309 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 GMFGO60234 142 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PGM3O95394 542 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KRT6AP02538 564 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 KRT6BP04259 564 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 PYGBP11216 843 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 HSD3B1P14060 373 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 TAC1P20366 129 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 HNF1AP20823 631 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 HSD3B2P26439 372 aa9.87□□□□□ -0.83
RNF4-218ENST00000513284 SHC1P29353 583 aa9.87□□□□□ -0.83
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