RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 RMND5AQ9H871 391 aa24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4-202ENST00000483873 DKKL1Q9UK85 242 aa24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.09■■□□□ 1.45
GTF3C4-202ENST00000483873 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GTF3C4-202ENST00000483873 GMFGO60234 142 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SOX30O94993 753 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPN3P20807 821 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SRD5A2P31213 254 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DCTP40126 519 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ADORA2A-AS1P86434 159 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 FUT5Q11128 374 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 FLYWCH1Q4VC44 716 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 COX20Q5RI15 118 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 C6orf10Q5SRN2 563 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DCST1Q5T197 706 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 METTL21CQ5VZV1 264 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF585AQ6P3V2 769 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 OR14L1PQ8NHC6 308 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2H4Q92759 462 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC52A3Q9NQ40 469 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.08■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ICE1Q9Y2F5 2266 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFB5O43674 189 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DPP4P27487 766 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 C17orf67Q0P5P2 114 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CD226Q15762 336 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 WLSQ5T9L3 541 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZFP90Q8TF47 636 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SPDL1Q96EA4 605 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 UGT2B28Q9BY64 529 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 TAS2R10Q9NYW0 307 aa24.07■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 E9PLN8 166 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 NPIPB9F8W1W9 429 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 HMGN4O00479 90 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SCDO00767 359 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZIC3O60481 467 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ANP32DO95626 131 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 HPGDP15428 266 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 BMP7P18075 431 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 VKORC1Q9BQB6 163 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 EXD2Q9NVH0 621 aa24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 A1L4Q6 167 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 FCMRO60667 390 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 AK1P00568 194 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZCCHC18P0CG32 403 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR68Q15743 365 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 VASNQ6EMK4 673 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 TIMP4Q99727 224 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHDC3Q9BQ90 382 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 MKLN1Q9UL63 735 aa24.05■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PQD3 144 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM107AO95990 144 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 MVDP53602 400 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP12AP54707 1039 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHL26Q53HC5 615 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 NHSL2Q5HYW2 709 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PAGE3Q5JUK9 113 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 RTL6Q6ICC9 239 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNEQ86WN2 208 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ROPN1LQ96C74 230 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNE5Q9UJ90 142 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 FIGNL2A6NMB9 653 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 STX11O75558 287 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 AGR2O95994 175 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ACVR2AP27037 513 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 GFRA1P56159 465 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 MTFR2Q6P444 385 aa24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF614Q8N883 585 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms