RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC35A4Q96G79 324 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ALG5Q9Y673 324 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PROM1O43490 865 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 IGHA1P01876 353 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ALAS2P22557 587 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 AHRP35869 848 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 INPP1P49441 399 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ACSM1Q08AH1 577 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 IRF4Q15306 451 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF620Q6ZNG0 422 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CPOQ8IVL8 374 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DUSP18Q8NEJ0 188 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2L3Q8NG85 312 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF681Q96N22 645 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM43Q9BTV4 400 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 RNF32Q9H0A6 362 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 MED17Q9NVC6 651 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0G2JMP0 313 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A0X1KG70 313 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM183AA6NL82 134 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM25AB3EWG3 89 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM25CB3EWG5 89 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM25GB3EWG6 89 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SEC13P55735 322 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 AGBL4Q5VU57 503 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 VASNQ6EMK4 673 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GIMAP5Q96F15 307 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SAMD8Q96LT4 415 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ASB6Q9NWX5 421 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 POLHQ9Y253 713 aa14.73□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PRR23AA6NEV1 266 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 KLF4O43474 513 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GAAP10253 952 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CTBP2P56545 445 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC32Q14392 662 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CST6Q15828 149 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 EOGTQ5NDL2 527 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 OR2T33Q8NG76 320 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 A0A1W2PP55 124 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CDC42EP2O14613 210 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 DVL2O14641 736 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SCAMP1O15126 338 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ASGR2P07307 311 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GPR89BP0CG08 455 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 NDUFV2P19404 249 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 BTN3A2P78410 334 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 C2orf27AQ580R0 203 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 COL26A1Q96A83 441 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ART5Q96L15 291 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 NLGN3Q9NZ94 848 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.72□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 OR5F1O95221 314 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 HMGN1P05114 100 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM157BP0CG42 384 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 GCGRP47871 477 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ABATP80404 500 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms