RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436539.1

AP006285.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AP006285.1, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP006285.1-201ENST00000436539 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.76□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 FBXL2Q9UKC9 423 aa9.76□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.76□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.76□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 LOC100653049A0A140TA62 436 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 EVPLLA8MZ36 301 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 FXYD1O00168 92 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 NDUFB5O43674 189 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TNFRSF21O75509 655 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 UGT2B17O75795 530 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 KRT34O76011 436 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 IGHG3P01860 377 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 HPNP05981 417 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 BCHEP06276 602 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 NUDT7P0C024 238 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 NR2F1P10589 423 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 COX4I1P13073 169 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CRISP3P54108 245 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MTPNP58546 118 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GPR68Q15743 365 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MAPK11Q15759 364 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ZNF141Q15928 474 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SYPL1Q16563 259 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 KLHL26Q53HC5 615 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RUNDC3AQ59EK9 446 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 PDZK1Q5T2W1 519 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TRILQ7L0X0 811 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MISPQ8IVT2 679 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 C10orf111Q8N326 155 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 POU5F2Q8N7G0 328 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ZNF614Q8N883 585 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 OR2M3Q8NG83 312 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RCN3Q96D15 328 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DTNBP1Q96EV8 351 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RUBCNLQ9H714 662 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MKLN1Q9UL63 735 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DSPPQ9NZW4 1301 aa9.75□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 FREM3P0C091 2139 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MED12Q93074 2177 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TMEM247A6NEH6 219 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SERINC4A6NH21 518 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 H3BNH8 94 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 HCN1O60741 890 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CBR3O75828 277 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TRAPPC6AO75865 159 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DCTN3O75935 186 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 PDE9AO76083 593 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TFPTP0C1Z6 253 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GPX2P18283 190 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SRD5A2P31213 254 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CHRNEQ04844 493 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RBPJQ06330 500 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SELPLGQ14242 412 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GNA13Q14344 377 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SLC10A1Q14973 349 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TOMM20Q15388 145 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 MAL2Q969L2 176 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 LRRC58Q96CX6 371 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TMEM19Q96HH6 336 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 LDAHQ9H6V9 325 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 CALML5Q9NZT1 146 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 KCNE5Q9UJ90 142 aa9.74□□□□□ -0.85
AP006285.1-201ENST00000436539 DKKL1Q9UK85 242 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms