RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 TNFSF11O14788 317 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 NDUFB5O43674 189 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CXCL13O43927 109 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PLIN3O60664 434 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PLGP00747 810 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PLAUP00749 431 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SHBGP04278 402 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 UROSP10746 265 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 FCGR2AP12318 317 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PCSK6P29122 969 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CTBP2P56545 445 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 OCRLQ01968 901 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 FGFBP1Q14512 234 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 IFT20Q8IY31 132 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 NUP43Q8NFH3 380 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 OR2T11Q8NH01 316 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 OR4C3Q8NH37 302 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 GIMAP5Q96F15 307 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ADGRG7Q96K78 797 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 RNF145Q96MT1 663 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 TSSK3Q96PN8 268 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 A0A1W2PRB8 838 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ALG1L2C9J202 215 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SLC28A1O00337 649 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 NKX2-2O95096 273 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ZNF17P17021 662 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SDC1P18827 310 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 MAP3K8P41279 467 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PTH2RP49190 550 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 DNAJB13P59910 316 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 RPL38P63173 70 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SLC18A2Q05940 514 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 DUSP5Q16690 384 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CCNJQ5T5M9 372 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ALKBH2Q6NS38 261 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PRSS57Q6UWY2 283 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CNPY4Q8N129 248 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CDRT4Q8N9R6 151 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 NUDT8Q8WV74 236 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PPCDCQ96CD2 204 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 REEP4Q9H6H4 257 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 C12orf49Q9H741 205 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 MED17Q9NVC6 651 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 C1orf109Q9NX04 203 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ZANQ9Y493 2812 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 A0A0J9YW62 118 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 TTC36A6NLP5 189 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 H3BQF6 201 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 KLF4O43474 513 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 RGS14O43566 566 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 KCNK2O95069 426 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SYNGR4O95473 234 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 NTN1O95631 604 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 LINC00032P0C843 101 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CPA3P15088 417 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 IL11P20809 199 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PRPH2P23942 346 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 SHC1P29353 583 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 MANFP55145 182 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CD226Q15762 336 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CCDC153Q494R4 210 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 GALNTL6Q49A17 601 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 BEX5Q5H9J7 111 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 HBMQ6B0K9 141 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 Q6ZSR9 355 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 PRIMA1Q86XR5 153 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 OR2V1Q8NHB1 315 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 POC1BQ8TC44 478 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-207ENST00000420709 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms