RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404424.5

CLIP4-204, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLIP4, Length 2,480 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4-204ENST00000404424 UPRTQ96BW1 309 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 C10orf90Q96M02 699 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RWDD3Q9Y3V2 267 aa10.01□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 UNC119BA6NIH7 251 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR52A4PA6NMU1 304 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 C12orf71A8MTZ7 269 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CDC42EP2O14613 210 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 LATO43561 262 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PIP5K1CO60331 668 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ADH1BP00325 375 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CEACAM5P06731 702 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ARSBP15848 533 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 BMP7P18075 431 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 C5AR1P21730 350 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TALDO1P37837 337 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ATP12AP54707 1039 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 BTN3A2P78410 334 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SHC2P98077 582 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RGS1Q08116 209 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 LTB4RQ15722 352 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RPE65Q16518 533 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 Q5BKY6 102 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 NIPAL3Q6P499 406 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SMARCD3Q6STE5 483 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 HDDC3Q8N4P3 179 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR7G2Q8NG99 324 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CD180Q99467 661 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ALG8Q9BVK2 526 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR52D1Q9H346 318 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TRIM36Q9NQ86 728 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TRPV5Q9NQA5 729 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CYSLTR2Q9NS75 346 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OBP2AQ9NY56 170 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 NTNG1Q9Y2I2 539 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ISM1B1AKI9 464 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ELK1P19419 428 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CAPZA2P47755 286 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RFX3P48380 749 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CTBP2P56545 445 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 GNG2P59768 71 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 BTG1P62324 171 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 MAB21L1Q13394 359 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CAMK1Q14012 370 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 GALEQ14376 348 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TJAP1Q5JTD0 557 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 FAM111BQ6SJ93 734 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TPRA1Q86W33 373 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR2L13Q8N349 312 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CDS1Q92903 461 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PRDM9Q9NQV7 894 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SPHK1Q9NYA1 384 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR6C2Q9NZP2 312 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 KLF15Q9UIH9 416 aa10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 BHLHE40O14503 412 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZGLP1P0C6A0 271 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PRKCAP17252 672 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 ZNF136P52737 540 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TAS2R43P59537 309 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 TNFRSF17Q02223 184 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SGCGQ13326 291 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 FGL2Q14314 439 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 INSL4Q14641 139 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 IDNKQ5T6J7 187 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 HACD4Q5VWC8 232 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PAQR7Q86WK9 346 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 LNX2Q8N448 690 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 NT5CQ8TCD5 201 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.99□□□□□ -0.81
CLIP4-204ENST00000404424 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms