RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 LSP1P33241 339 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DCTP40126 519 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL26Q53HC5 615 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 DSN1Q9H410 356 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.01□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.01□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 EVPLLA8MZ36 301 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A2O15244 555 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTL6AO96019 429 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 GNGT1P63211 74 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 GPR68Q15743 365 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF141Q15928 474 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 C3AR1Q16581 482 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 GXYLT1Q4G148 440 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 AP1ARQ63HQ0 302 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 AAGABQ6PD74 315 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP6Q6UWR7 440 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 CALML5Q9NZT1 146 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MED11Q9P086 117 aa14□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RX2Q9UBL9 471 aa14□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN13Q12923 2485 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC18AA5D8T8 446 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 E9PLN8 166 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NPIPB9F8W1W9 429 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01387J3KSC0 135 aa13.99□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 SEC24CP53992 1094 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DSTNP60981 165 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 RGNQ15493 299 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 EIPR1Q53HC9 387 aa13.99□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.99□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.99□□□□□ -0.17
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf82Q8WW14 230 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM107BQ9H098 131 aa13.99□□□□□ -0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SAP130Q9H0E3 1048 aa13.99□□□□□ -0.17
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