RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LRR1Q96L50 414 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BOCQ9BWV1 1114 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FN3KQ9H479 309 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RDH8Q9NYR8 311 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GDE1Q9NZC3 331 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LHX3Q9UBR4 397 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EDARQ9UNE0 448 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ICKQ9UPZ9 632 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NOTCH4Q99466 2003 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PPL8 197 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TOR1AO14656 332 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TSPAN3O60637 253 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 STX11O75558 287 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NFATC1O95644 943 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CATP04040 527 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FAM87AP0C7U9 286 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AHCYP23526 432 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DNASE1P24855 282 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PPP2R1BP30154 601 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LCN1P31025 176 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ETV5P41161 510 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF81P51508 661 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ARF5P84085 180 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SEMG2Q02383 582 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf80Q0P641 193 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RPA4Q13156 261 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 GPR176Q14439 515 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FGFBP1Q14512 234 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FCN2Q15485 313 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNA6Q15825 494 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF77Q15935 545 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NTRK2Q16620 822 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OAFQ86UD1 273 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 SHISA5Q8N114 240 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF4L2Q8NA75 395 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 OR56B4Q8NH76 319 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FIBINQ8TAL6 211 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RNFT2Q96EX2 444 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ASIC4Q96FT7 647 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CMTM3Q96MX0 182 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 FOPNLQ96NB1 174 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 WACQ9BTA9 647 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 CDIP1Q9H305 208 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 AHSPQ9NZD4 102 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 LIPT1Q9Y234 373 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0C4DFX4 3053 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM77I1YAP6 450 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 M0R129 80 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 TBX19O60806 448 aa6.72□□□□□ -1.33
CTPS1-201ENST00000372616 IGSF6O95976 241 aa6.72□□□□□ -1.33
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