RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 CIB4A0PJX0 185 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SNTNA6NMZ2 147 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 E9PI62 339 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 GABRPO00591 440 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 DPM1O60762 260 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PRKAR1AP10644 381 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ELK1P19419 428 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 IGFBP4P22692 258 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PYCR1P32322 319 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 EFR3AQ14156 821 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SLC9A5Q14940 896 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 POU4F3Q15319 338 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 TEX19Q8NA77 164 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 GATSQ8NAP1 163 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 NUP43Q8NFH3 380 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RGMAQ96B86 450 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RAD9AQ99638 391 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 IFT27Q9BW83 186 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 E9PQ18 207 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 H0Y8X5 98 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 IMPA2O14732 288 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MPZL2O60487 215 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RAD1O60671 282 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR5F1O95221 314 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 CA3P07451 260 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PVRP15151 417 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PSMB10P40306 273 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SLC1A3P43003 542 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PDE7AQ13946 482 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 FGFBP1Q14512 234 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ZNF234Q14588 700 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PARGQ86W56 976 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 TMEM99Q8N816 258 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 NEURL3Q96EH8 262 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 TAPBPLQ9BX59 468 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SGPP1Q9BX95 441 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 LHX9Q9NQ69 397 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 NDUFB11Q9NX14 153 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RASD1Q9Y272 281 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MAU2Q9Y6X3 613 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 LRRK1Q38SD2 2015 aa8.3□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 DAPL1A0PJW8 107 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SH3D21A4FU49 640 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 PEX12O00623 359 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 FABP7O15540 132 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 EPPINO95925 133 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ASGR2P07307 311 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 LIMS3P0CW19 117 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 LIMS4P0CW20 117 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 BCL6P41182 706 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 FCN2Q15485 313 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MTSS1LQ765P7 747 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RNF44Q7L0R7 432 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 ACOT4Q8N9L9 421 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR4Q3Q8NH05 313 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 OR8D1Q8WZ84 308 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 VWCEQ96DN2 955 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 QRFPRQ96P65 431 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MICU1Q9BPX6 476 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 CCDC32Q9BV29 185 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 MS4A8Q9BY19 250 aa8.29□□□□□ -1.08
THBS3-201ENST00000368378 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms