RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ISM1B1AKI9 464 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C1QBP02746 253 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CEACAM5P06731 702 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 FGL2Q14314 439 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 SNAP47Q5SQN1 464 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 HBMQ6B0K9 141 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 OR52L1Q8NGH7 329 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf90Q96M02 699 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PTGFRNQ9P2B2 879 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa17■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 UNC119BA6NIH7 251 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 FAM183AA6NL82 134 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ALX3O95076 343 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ADH1BP00325 375 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 THBS1P07996 1170 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 GZMKP49863 264 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TNFRSF17Q02223 184 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RPE65Q16518 533 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ALG8Q9BVK2 526 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 OR52D1Q9H346 318 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 EXTL2Q9UBQ6 330 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ELK1P19419 428 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 VEGFBP49765 207 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF136P52737 540 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TNK1Q13470 666 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PLCZ1Q86YW0 608 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 OR2L13Q8N349 312 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.99■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TRAPPC13A5PLN9 417 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 KAT7O95251 611 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ARSBP15848 533 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 C5AR1P21730 350 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 F8A1P23610 371 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CTBP2P56545 445 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RGS1Q08116 209 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 DUSP8Q13202 625 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 IDNKQ5T6J7 187 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 OR5M3Q8NGP4 307 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 INPP5EQ9NRR6 644 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.98■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PP55 124 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 AGRPO00253 132 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF9O43307 516 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PRKCAP17252 672 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CD53P19397 219 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 TALDO1P37837 337 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 GALK2Q01415 458 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PAQR7Q86WK9 346 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 KCT2Q8NC54 265 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CD180Q99467 661 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 PRSS27Q9BQR3 290 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 WACQ9BTA9 647 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 CYSLTR2Q9NS75 346 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 RWDD3Q9Y3V2 267 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0G2JMP0 313 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0X1KG70 313 aa16.97■□□□□ 0.31
SPNS3-201ENST00000355530 BHLHE40O14503 412 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms