RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.77□□□□□ -0.04
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PDGFB-201ENST00000331163 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 ASIC5Q9NY37 505 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFB-201ENST00000331163 SLC22A1O15245 554 aa14.74□□□□□ -0.05
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