RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 SLC13A2Q13183 592 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 OR4Q3Q8NH05 313 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CAPN10Q9HC96 672 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 MED17Q9NVC6 651 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 SURF4O15260 269 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK2O95069 426 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 S100A5P33763 92 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 STX4Q12846 297 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PGGHGQ32M88 737 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RFKQ969G6 155 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.18■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 LILRA5A6NI73 299 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CDC42EP2O14613 210 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FOXS1O43638 330 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CH25HO95992 272 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 S1PR1P21453 382 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CD40LGP29965 261 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM16LQ309B1 348 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PERM1Q5SV97 790 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 OR2T33Q8NG76 320 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PEX11GQ96HA9 241 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 EVA1AQ9H8M9 152 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 HYKKA2RU49 373 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 BLACEA4D250 179 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TAF4O00268 1085 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CTNSO60931 367 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 MED26O95402 600 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 IFITM3Q01628 133 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM239Q8WW34 195 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RIT1Q92963 219 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 MROQ9BYG7 248 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FOLH1BQ9HBA9 442 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 STUB1Q9UNE7 303 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 HMGN1P05114 100 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PSMD7P51665 324 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CDH11P55287 796 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PSG6Q00889 435 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 OXA1LQ15070 435 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RNF217Q8TC41 542 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PEX16Q9Y5Y5 336 aa20.16■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM129A0AVI4 362 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 UNC119BA6NIH7 251 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PTNP21246 168 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 MAOBP27338 520 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CRYBB2P43320 205 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RFX3P48380 749 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 WNT4P56705 351 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FAM53BQ14153 422 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 AADACL4Q5VUY2 407 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 WDR88Q6ZMY6 472 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ZAR1Q86SH2 424 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PHC2Q8IXK0 858 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 SAMD8Q96LT4 415 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN4O14493 209 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 APOL3O95236 402 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 LYPD3O95274 346 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 NSA2O95478 260 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 GUSBP08236 651 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 DRD5P21918 477 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 RANBP1P43487 201 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 EMDP50402 254 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 FZD5Q13467 585 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ABHD8Q96I13 439 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF559Q9BR84 538 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 ASPNQ9BXN1 380 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 DPH1Q9BZG8 443 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 CHRDQ9H2X0 955 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.15■□□□□ 0.82
SPHK1-201ENST00000323374 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms