RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SIGLEC5O15389 551 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CD79BP40259 229 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP1Q07960 439 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SIGLEC14Q08ET2 396 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ETFDHQ16134 617 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC9B2Q86UD5 537 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NAA40Q86UY6 237 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TRIB3Q96RU7 358 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OSER1Q9NX31 292 aa15.64■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR6A2O95222 327 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A1P30531 599 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NUMA1Q14980 2115 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR8J2Q8NGG1 315 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 C14orf79Q96F83 325 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 KXD1Q9BQD3 176 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FRS3O43559 492 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PRR5P85299 388 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GAB1Q13480 694 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PIGMQ9H3S5 423 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM129A0AVI4 362 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GPR37L1O60883 481 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 MMP3P08254 477 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CKBP12277 381 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NDUFV2P19404 249 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CD34P28906 385 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 S100A10P60903 97 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ELOA3BQ3SY89 546 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 BVESQ8NE79 360 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ELOA3Q8NG57 546 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SYT4Q9H2B2 425 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.63■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LIPCP11150 499 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HOXD10P28358 340 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TPBGQ13641 420 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SAMD8Q96LT4 415 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 QSOX1O00391 747 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 BPIP17213 487 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 XCR1P46094 333 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CCR9P51686 369 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 DSC1Q08554 894 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 CDH26Q8IXH8 852 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FBLIM1Q8WUP2 373 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SLC19A3Q9BZV2 496 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TDP1Q9NUW8 608 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 HRO43593 1189 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RCBTB2O95199 551 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ACRV1P26436 265 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF529Q6P280 563 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 C5AR2Q9P296 337 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.62■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB42B2RXF5 422 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 ACOT7O00154 380 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 RGRP47804 291 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 PREPP48147 710 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 INSL4Q14641 139 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 XKR4Q5GH76 650 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 NRMQ8IXM6 262 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 OR51A7Q8NH64 312 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 WDR48Q8TAF3 677 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 SEC22AQ96IW7 307 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.61■□□□□ 0.09
PACS1-201ENST00000320580 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.61■□□□□ 0.09
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