RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 UGT2B7P16662 529 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF100Q8IYN0 542 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 COQ10AQ96MF6 247 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CIB4A0PJX0 185 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SMCO3A2RU48 225 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FTCDNL1E5RQL4 147 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC14AQ86T13 490 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD6LQ8IWD5 586 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MYH15Q9Y2K3 1946 aa19.92■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN24A6NM45 220 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 B8ZZF3 427 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 EGFP01133 1207 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TFP02787 698 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HACD4Q5VWC8 232 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 APOOQ9BUR5 198 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SYNPO2LQ9H987 977 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RAB3DO95716 219 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM225BP0DP42 221 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MTFR2Q6P444 385 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 S100PBPQ96BU1 408 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ATG12O94817 140 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TLE3Q04726 772 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PPA1Q15181 289 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CTSL3PQ5NE16 218 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR10Q9NZ32 417 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS21Q9Y6M0 314 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GOSR2O14653 212 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 NTHL1P78549 312 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACSM3Q53FZ2 586 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF611Q8N823 705 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MMP28Q9H239 520 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa19.91■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GJE1A6NN92 205 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FRS3O43559 492 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 IL1AP01583 271 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 IFNGR1P15260 489 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R31P59538 309 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1211LQ6NV74 962 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SLC39A11Q8N1S5 342 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF480Q8WV37 535 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFA2Q96DR5 249 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF285Q96NJ3 590 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 POT1Q9NUX5 634 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C2Q9NZP2 312 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 F5H5P2 479 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 P04436 131 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ALPLP05186 524 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC13P31276 330 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH8Q5T0T0 291 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A19Q695T7 634 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD7Q86VX2 200 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM163Q8TC26 289 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 NT5DC2Q9H857 520 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CAMLGP49069 296 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CTSCP53634 463 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DEFB110Q30KQ9 67 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ELMOD3Q96FG2 381 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0J9YY10 115 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 A6NLC8 198 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SSX5O60225 188 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 PRLHRP49683 370 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SGSHP51688 502 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GGTA1PQ4G0N0 100 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP77Q6ZQR2 320 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 BADQ92934 168 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SNAPC3Q92966 411 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 EGLN2Q96KS0 407 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR8U9P0C7N5 309 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 GLO1Q04760 184 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR51J1Q9H342 316 aa19.9■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR52A4PA6NMU1 304 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RFPL3O75679 317 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DAP3P51398 398 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 DCST2Q5T1A1 773 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD11Q693B1 232 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 FCRLBQ6BAA4 426 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF534Q76KX8 674 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 IL17RCQ8NAC3 791 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 OR5B12Q96R08 314 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.89■□□□□ 0.78
CCSAP-201ENST00000284617 SACM1LQ9NTJ5 587 aa19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms