RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602212.5

NPAS1-208, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS1, Length 2,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPAS1-208	ENST00000602212	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	AACS	Q86V21	672 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ERC2	O15083	957 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	USP26	Q9BXU7	913 aa		27.94	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ARX	Q96QS3	562 aa		27.93	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	USP21	Q9UK80	565 aa		27.93	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	REC8	O95072	547 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	CHML	P26374	656 aa		27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	KCNQ2	O43526	872 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	SIK1	P57059	783 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	HLF	Q16534	295 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	GPATCH3	Q96I76	525 aa		27.91	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	PALLD	Q8WX93	1383 aa		27.9	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.9	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	RREB1	Q92766	1687 aa		27.9	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	ATP6V1A	P38606	617 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.89	■■■□□ 2.06
NPAS1-208	ENST00000602212	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.89	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	NUP98	P52948	1817 aa		27.88	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	HSPA1L	P34931	641 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	ITPK1	Q13572	414 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	SNX21	Q969T3	373 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	GPT	P24298	496 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	TFCP2	Q12800	502 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	HSCB	Q8IWL3	235 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	FAM89A	Q96GI7	184 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPAS1-208	ENST00000602212	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	NBR1	Q14596	966 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	IL25	Q9H293	177 aa		27.8	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	SYNE4	Q8N205	404 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		27.78	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	RABEP1	Q15276	862 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	AFF2	P51816	1311 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	NHS	Q6T4R5	1651 aa		27.76	■■■□□ 2.04
NPAS1-208	ENST00000602212	EYA2	O00167	538 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CSF1R	P07333	972 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	BTAF1	O14981	1849 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.76	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	MYH3	P11055	1940 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	SGSM2	O43147	1006 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CIAO1	O76071	339 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.75	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		27.74	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.73	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	ATRN	O75882	1429 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.72	■■■□□ 2.03
NPAS1-208	ENST00000602212	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03

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