RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCIRG1Q13488 830 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SEPT12Q8IYM1 358 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COPRSQ9NQ92 184 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RILPL2Q969X0 211 aa32.38■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACSBG1Q96GR2 724 aa32.38■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ERC2O15083 957 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIF2CQ99661 725 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A0G2JS52 829 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 REC8O95072 547 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYT1Q01538 1121 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLHDC4Q8TBB5 520 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP26Q9BXU7 913 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIL1Q9H173 461 aa32.37■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FOXO4P98177 505 aa32.36■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa32.35■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AACSQ86V21 672 aa32.35■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPATCH3Q96I76 525 aa32.35■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BRWD3Q6RI45 1802 aa32.34■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHMLP26374 656 aa32.34■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.34■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ECHDC1Q9NTX5 307 aa32.34■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.33■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AK9Q5TCS8 1911 aa32.32■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa32.32■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNX21Q969T3 373 aa32.31■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNTROBQ8N137 903 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EP400Q96L91 3159 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa32.3■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSCBQ8IWL3 235 aa32.29■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARXQ96QS3 562 aa32.29■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.28■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIK1P57059 783 aa32.28■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP6V1AP38606 617 aa32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PALLDQ8WX93 1383 aa32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HLFQ16534 295 aa32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RREB1Q92766 1687 aa32.25■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ERVV-1B6SEH8 477 aa32.25■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC87Q9NVE4 849 aa32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNQ2O43526 872 aa32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SOCS7O14512 581 aa32.23■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM182BQ5T319 152 aa32.23■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLA2G12BQ9BX93 195 aa32.23■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF5P55010 431 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TFCP2Q12800 502 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NUP98P52948 1817 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRKLP46109 303 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ITPK1Q13572 414 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RABEP1Q15276 862 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNNI3KQ59H18 835 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NLRP10Q86W26 655 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa32.22■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NBR1Q14596 966 aa32.21■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CDHR2Q9BYE9 1310 aa32.2■■■□□ 2.75
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM89AQ96GI7 184 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF831Q5JPB2 1677 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPTP24298 496 aa32.19■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EVI5LQ96CN4 794 aa32.18■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANTXR1Q9H6X2 564 aa32.18■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATG9AQ7Z3C6 839 aa32.17■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANO2Q9NQ90 1003 aa32.17■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IL15P40933 162 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EYA2O00167 538 aa32.15■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CIAO1O76071 339 aa32.15■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SGSM2O43147 1006 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CSF1RP07333 972 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MCCP23508 829 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF34Q8IZ26 560 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IL25Q9H293 177 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPR108Q9NPR9 543 aa32.14■■■□□ 2.74
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC57Q2TAC2 916 aa32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms