RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 RILPL2Q969X0 211 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 SIK1P57059 783 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 CHMLP26374 656 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 KAZALD1Q96I82 304 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 LY75O60449 1722 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 MCCP23508 829 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 CNTROBQ8N137 903 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 TJP1Q07157 1748 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF26B4DH59 902 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF14Q5TI25 921 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF15Q8N660 670 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 ATP6V1AP38606 617 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 ST18O60284 1047 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 ITPK1Q13572 414 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS3-204ENST00000575194 PLSCR1O15162 318 aa22.77■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 A0A087WZG4 1122 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 STARD3NLO95772 234 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 IL27Q8NEV9 243 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 APBA3O96018 575 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 ANAPC15P60006 121 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 AACSQ86V21 672 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 COPRSQ9NQ92 184 aa22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 A1BGP04217 495 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 KCNQ4P56696 695 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.74■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 SASH1O94885 1247 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 DDIT3P35638 169 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CASP7P55210 303 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 PROM2Q8N271 834 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.72■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 H7C1W4 665 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.71■■□□□ 1.23
SPNS3-204ENST00000575194 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 EVI5LQ96CN4 794 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 IL17RAQ96F46 866 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 SIL1Q9H173 461 aa22.7■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 HIP1O00291 1037 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 TXNRD1Q16881 649 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RREB1Q92766 1687 aa22.69■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 SGSM2O43147 1006 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 MCM2P49736 904 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.67■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 RAD50Q92878 1312 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.66■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 FOXO4P98177 505 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC125Q86Z20 511 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.65■■□□□ 1.22
SPNS3-204ENST00000575194 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms