RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 CEP85Q6P2H3 762 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP1-204ENST00000553277 DCTPP1Q9H773 170 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP1-204ENST00000553277 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP1-204ENST00000553277 HLFQ16534 295 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 BCORQ6W2J9 1755 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ADRA2BP18089 450 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 CASP7P55210 303 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 H7C1W4 665 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 GNPATO15228 680 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 MTX1Q13505 466 aa23.04■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 ATP8B2P98198 1209 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 NARFQ9UHQ1 456 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 KAZALD1Q96I82 304 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 NLRP10Q86W26 655 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 AK7Q96M32 723 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP1-204ENST00000553277 SCN7AQ01118 1682 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 SNX21Q969T3 373 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 SSFA2P28290 1259 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 GSE1Q14687 1217 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 ARXQ96QS3 562 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 SSH3Q8TE77 659 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 AKT1S1Q96B36 256 aa23■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 C4AP0C0L4 1744 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 HMMRO75330 724 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 POLA2Q14181 598 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 SUCLG2Q96I99 432 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 CCDC125Q86Z20 511 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 PARP10Q53GL7 1025 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.96■■□□□ 1.27
LRP1-204ENST00000553277 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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LRP1-204ENST00000553277 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.95■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 BCL11AQ9H165 835 aa22.95■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 GPTP24298 496 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 SMIM5Q71RC9 77 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 HSCBQ8IWL3 235 aa22.94■■□□□ 1.26
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LRP1-204ENST00000553277 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 FOXO4P98177 505 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 ZNF827Q17R98 1081 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.265e-6■■□□□ 13.5
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LRP1-204ENST00000553277 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.9■■□□□ 1.26
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LRP1-204ENST00000553277 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 NTSR2O95665 410 aa22.9■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LRP1-204ENST00000553277 PHF14O94880 888 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 CSF1RP07333 972 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.89■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.88■■□□□ 1.25
LRP1-204ENST00000553277 GYS1P13807 737 aa22.87■■□□□ 1.25
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