RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ERC2O15083 957 aa13.23□□□□□ -0.29
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SH3BP2-209ENST00000504450 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
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SH3BP2-209ENST00000504450 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 SIL1Q9H173 461 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 CASZ1Q86V15 1759 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 HSPA4P34932 840 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP2-209ENST00000504450 TFCP2Q12800 502 aa13.11□□□□□ -0.31
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