RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 LRP8Q14114 963 aa7.16□□□□□ -1.26
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SENP6-210ENST00000487548 PNMA5Q96PV4 448 aa7.16□□□□□ -1.26
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SENP6-210ENST00000487548 USP17L4A6NCW7 530 aa7.15□□□□□ -1.26
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SENP6-210ENST00000487548 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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SENP6-210ENST00000487548 ZFATQ9P243 1243 aa7.04□□□□□ -1.28
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SENP6-210ENST00000487548 RARAP10276 462 aa7.03□□□□□ -1.28
SENP6-210ENST00000487548 EPB42P16452 691 aa7.03□□□□□ -1.28
SENP6-210ENST00000487548 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SENP6-210ENST00000487548 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
SENP6-210ENST00000487548 SEC13P55735 322 aa7.03□□□□□ -1.28
SENP6-210ENST00000487548 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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SENP6-210ENST00000487548 RNF112Q9ULX5 631 aa7.03□□□□□ -1.28
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SENP6-210ENST00000487548 DKK1O94907 266 aa7.02□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 GRIK5Q16478 980 aa7.02□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 PCSK7Q16549 785 aa7.02□□□□□ -1.29
SENP6-210ENST00000487548 IER5Q5VY09 327 aa7.02□□□□□ -1.29
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