RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF2CQ99661 725 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 ARXQ96QS3 562 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 USP21Q9UK80 565 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 AACSQ86V21 672 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNQ2O43526 872 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 USP26Q9BXU7 913 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 HLFQ16534 295 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 ERC2O15083 957 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMLP26374 656 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 PALLDQ8WX93 1383 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V1AP38606 617 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 SIK1P57059 783 aa26.4■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPA1LP34931 641 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP5-204ENST00000412806 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 REC8O95072 547 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 ITPK1Q13572 414 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 MYT1Q01538 1121 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 GPATCH3Q96I76 525 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH3P11055 1940 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 CNTROBQ8N137 903 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 GPTP24298 496 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 TFCP2Q12800 502 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP10Q86W26 655 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM89AQ96GI7 184 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 BTAF1O14981 1849 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 SNX21Q969T3 373 aa26.33■■□□□ 1.81
SH3BP5-204ENST00000412806 NHSQ6T4R5 1651 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 HSCBQ8IWL3 235 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 TNNI3KQ59H18 835 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 NBR1Q14596 966 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 SYNE4Q8N205 404 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 IL25Q9H293 177 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 AFF2P51816 1311 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 SBF2Q86WG5 1849 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 BCORQ6W2J9 1755 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SH3BP5-204ENST00000412806 EYA2O00167 538 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 CSF1RP07333 972 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC24Q50LG9 513 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 EVI5LQ96CN4 794 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 RABEP1Q15276 862 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM182BQ5T319 152 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.26■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 ATRNO75882 1429 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 CIAO1O76071 339 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 CAMTA2O94983 1202 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 SGSM2O43147 1006 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP5-204ENST00000412806 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms