RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 RRM1P23921 792 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 DHRS1Q96LJ7 313 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 ATG3Q9NT62 314 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-202ENST00000380828 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf50Q8WW18 174 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF24P17028 368 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS6KA3P51812 740 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBED6P86452 979 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D5Q92609 795 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GINM1Q9NU53 330 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CSPG5O95196 566 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ENPP1P22413 925 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP2R5BQ15173 497 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNN1Q92952 543 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC3BQ9H195 1237 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 VEZTQ9HBM0 779 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SMC5Q8IY18 1101 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PYGBP11216 843 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF1Q13077 416 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 USP25Q9UHP3 1055 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1BO43795 1136 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SETSIPP0DME0 302 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf80Q86SX3 495 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 FEZ1Q99689 392 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.121e-7■■□□□ 13.3
RABGEF1-202ENST00000380828 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO41Q8TF61 875 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MTRQ99707 1265 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MRS2Q9HD23 443 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 COPB2P35606 906 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDCQ9Y266 331 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ALKQ9UM73 1620 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 COG6Q9Y2V7 657 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 E9PCH4 1651 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 DIP2AQ14689 1571 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MMEP08473 750 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC175P0C221 793 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ST7Q9NRC1 585 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYM3Q14202 1370 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP13Q86W25 1043 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO1HQ8N1T3 1032 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 GPT2Q8TD30 523 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 ERVK-7P63135 1459 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP11B2P19099 503 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 MIEF2Q96C03 454 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGEF1-202ENST00000380828 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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