RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
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GGPS1-201ENST00000282841 UTYO14607 1347 aa13.52□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.52□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 TCIRG1Q13488 830 aa13.52□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 ERBB4Q15303 1308 aa13.52□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa13.51□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 FOXO4P98177 505 aa13.51□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 LINC00116Q8NCU8 138 aa13.5□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.5□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.5□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.49□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 CDC45O75419 566 aa13.49□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 ISCA1Q9BUE6 129 aa13.49□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 LRRC24Q50LG9 513 aa13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 RAB11FIP3O75154 756 aa13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 NLRP10Q86W26 655 aa13.48□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.48□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 ZMYND15Q9H091 742 aa13.47□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 PHF14O94880 888 aa13.47□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
GGPS1-201ENST00000282841 FGD1P98174 961 aa13.47□□□□□ -0.25
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GGPS1-201ENST00000282841 SUSD4Q5VX71 490 aa13.45□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 NUP188Q5SRE5 1749 aa13.45□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 GREM2Q9H772 168 aa13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 GNPATO15228 680 aa13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 CAMTA2O94983 1202 aa13.43□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 UTRNP46939 3433 aa13.43□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 COPRSQ9NQ92 184 aa13.43□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 ATG9AQ7Z3C6 839 aa13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 LRRC4BQ9NT99 713 aa13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 SNAP23O00161 211 aa13.42□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.42□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 TAF7LQ5H9L4 462 aa13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
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GGPS1-201ENST00000282841 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.42□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 CHMLP26374 656 aa13.41□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 SLFNL1Q499Z3 407 aa13.41□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 TNNI3KQ59H18 835 aa13.41□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.41□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.41□□□□□ -0.26
GGPS1-201ENST00000282841 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa13.41□□□□□ -0.26
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