RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLITRK2	Q9H156	845 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	USP22	Q9UPT9	525 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A096LPI6	279 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LRIT2	A6NDA9	550 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MYMK	A6NI61	221 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		D6RAR5	112 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DLGAP1	O14490	977 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SIX6	O95475	246 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MT-ND5	P03915	603 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LCAT	P04180	440 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TH	P07101	528 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR56A5	P0C7T3	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PET100	P0DJ07	73 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SERPINA4	P29622	427 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GRK5	P34947	590 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ELK3	P41970	407 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MAX	P61244	160 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FCN2	Q15485	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF790	Q6PG37	636 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC34A3	Q8N130	599 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	LCORL	Q8N3X6	602 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CERS5	Q8N5B7	392 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF152	Q8N8N0	203 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CXorf58	Q96LI9	332 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF382	Q96SR6	550 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	NT5DC2	Q9H857	520 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	KPTN	Q9Y664	436 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A1B0GUH1	482 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CLDN24	A6NM45	220 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GLCE	O94923	617 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PRAMEF1	O95521	474 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	IGF2	P01344	180 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GPI	P06744	558 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF35	P13682	527 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ELN	P15502	786 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	AREG	P15514	252 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GADD45A	P24522	165 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TM4SF1	P30408	202 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CASR	P41180	1078 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	RAB5C	P51148	216 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM33	P57088	247 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	DAOA	P59103	153 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CSNK1G2	P78368	415 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	GABPA	Q06546	454 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OPCML	Q14982	345 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	CES5A	Q6NT32	575 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SSX7	Q7RTT5	188 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ABHD3	Q8WU67	409 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	HMGB4	Q8WW32	186 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	ARRDC3	Q96B67	414 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	YIPF6	Q96EC8	236 aa		5.79	□□□□□ -1.48
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.79	□□□□□ -1.48

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